Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms