Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms