Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2a1Q99PM3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms