Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim8Q99PJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms