Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GpnmbQ99P91 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GpnmbQ99P91 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms