Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms