Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca3Q99M54 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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