Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms