Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp1b1Q99LU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms