Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99KU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99KU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms