Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufsp2Q99K23 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp2Q99K23 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms