Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GatbQ99JT1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms