Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctu1Q99J10 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctu1Q99J10 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms