Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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