Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf144aQ925F3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms