Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms