Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cts3Q91ZD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms