Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd3Q91WC0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms