Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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