Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Top1mtQ8R4U6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1mtQ8R4U6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1mtQ8R4U6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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