Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms