Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r200Q8R281 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r200Q8R281 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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