Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms