Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms