Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hecw1Q8K4P8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hecw1Q8K4P8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms