Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms