Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrdQ8K2M3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms