Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Fbxo18Q8K2I9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fbxo18Q8K2I9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Fbxo18Q8K2I9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo18Q8K2I9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms