Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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