Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms