Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnppd1Q8K158 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnppd1Q8K158 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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