Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms