Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms