Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms