Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1rbQ8CFG9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1rbQ8CFG9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms