Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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