Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx8Q8CFD4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms