Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol7cQ8C6E1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol7cQ8C6E1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms