Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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