Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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