Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtpaQ8BWP5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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