Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdhaf4Q8BTE0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf4Q8BTE0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms