Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms