Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms