Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms