Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms