Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms