Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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