Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrfn4Q80XU8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrfn4Q80XU8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms