Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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